虽然国债被称为“金边债券”，但并不是说投资国债没有风险。凭证式国债的风险主要有两点，即加息和时间成本。加息不管对于凭证式国债还是记账式国债来说都不是好事，因为，银行的利息升了也就意味着债券的利息收入减少了。以目前市场普遍预测央行存款会加息0.25%为例，若投资者买了10万元一年凭证式国债，利率为1.98%，他一年后的实际收益为1980元。而加息后，每年收益达到了2030元，这样，投资者买国债反而亏损了50元。
而三年、五年甚至更长期的国债投资者不仅有可能承受连续加息的风险，在持有期里，投资人只能看着利息上涨而毫无办法。因为国债的收益一般都是在期满时才能得到，且到期一次还本付息，不计复利。即投资者只有在债券到期时才能连本带利收回资金，如果中途有急事需要支取，就要蒙受一定的利息损失。
