近期，通过巴中调查队调查显示，巴中民营医院既具有就诊程序简捷、服务态度较好、收费价格较低等优势，同时，也由于基本保障不足、投资主体复杂、配套政策不完善等不利因素，致使当前巴中市民营医院的发展存在以下五大不足。
（一）医疗队伍稳定性较差。民营医院大多是民间社会资金投资兴办，为了追求短期效益，不注重人才储备和培养，大都是招聘中专卫校刚毕业的学生和其他公立医院的退休医生，中青年骨干人员较少。民营医院待遇普遍偏低，且工作强度较高，难成功招聘到优秀的医学院应届本科或硕士毕业生，即便招聘的，大都只将民营医院作为暂时的立足之地，而将考取公立医院作为最终奋斗目标，导致医疗队伍稳定性较差。
（二）医疗技术水平总体偏低。全市37家非公立医疗机构中，二级甲等医院1家,二级乙等医院1家，一级甲等医院6家，且大部分为专科医院，除了市骨科医院在骨科技术方面有较强的专业技术优势，能完成一些技术难度较大的手术外，其他医院普遍只治疗一些常见病症，如遇大病重症只能转院，医疗技术水平与公立医院相比存在较大差距。
（三）行业信誉度有待提升。少部分民营医院借助现代媒体，发布虚假广告招揽病人，极大地影响了医疗行业的形象。一些民营医院擅自增加诊疗项目，超范围行医，通过开大处方、滥做检查、过度治疗来牟取钱财，导致医患纠纷频发。还有部分为了追逐利益最大化，常发生费用清单与医嘱不符、虚列医疗费用、虚假住院、串换医保内外项目等违规行为。近年来，因违反医保定点医疗机构服务协议而被处罚的民营医院数量远远多于公立医院。
能再免除企业所得税，降低医院税赋，以便促进医院设备的购置和条件的改善。三是虽然现在民营医院收费实行市场调节价，但若超出医保局的报销额度，医疗保险基金将难按规定给予支付，收费能再免除企业所得税，降低医院税赋，以便促进医院设备的购置和条件的改善。三是虽然现在民营医院收费实行市场调节价，但若超出医保局的报销额度，医疗保险基金将难按规定给予支付，收费标准与物价上涨不相适应，严重影响着医院的正常收入。
（五）对民营医院扶持力度不够。一是对民营医院的信任度不高，如一些乡镇卫生院在给病人进行转院时，明确规定只能转往公立医院；患者对民营医院的信任度远低于公立医院，一出现问题，很容易和医院发生纠纷，独自应对医疗风险的压力很大。二是大部分医院负责人反映政府在土地出让、房屋建设、设备购买、人才引进等方面对民营医院基本没有投入和支持。相关资料显示，2013年全市民营医院总收入2167万元，但财政补助收入为“零”。三是难以享受到慈善机构的设备捐赠与爱心捐助。
